EN
ChIP-seq ChIP-seq


  染色質免疫共沉淀技術(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)是研究體內蛋白質與DNA相互作用的有力工具,通常用于轉錄因子結合位點或組蛋白特異性修飾位點的研究。將ChIP與新一代測序技術相結合的ChIP-seq技術,能夠高效地在全基因組范圍內檢測與組蛋白、轉錄因子等互作的DNA區段。


       ChIP-Seq首先通過染色質免疫共沉淀技術(ChIP)特異性地富集目的蛋白結合的DNA片段,并對其進行純化與文庫構建,然后對富集得到的DNA片段進行高通量測序。研究人員通過將獲得的數百萬條序列標簽精確定位到基因組上,從而獲得全基因組范圍內與組蛋白、轉錄因子等互作的DNA區段信息。




實驗流程




技術參數


樣本類型:已ChIP富集的DNA樣品,樣本總量≥50 ng,樣本濃度≥10 ng/μL
測序策略:HiSeq SE50,推薦測序數據量:≥10M clean reads(轉錄因子),≥20 M clean reads(組蛋白)
項目周期:35個工作日

生物信息分析內容


1、數據質控
2、與參考序列比對
3、單樣本分析
3.1 Motif分析
3.2 Peaks注釋與概況
3.3 Peaks相關基因功能富集分析
4、多樣本分析
4.1 Motif分析
4.2 Peaks注釋與概況
4.3 Peaks相關基因功能富集分析
4.4 差異Peak分析
4.5 差異Peaks相關基因注釋與功能富集分析
4.6 SCC分析










足球大小球竞猜app 开店卖土特产赚钱吗 全民福州麻将 安卓版 坐飞机买延误险赚钱 棋牌麻将辅助真的假的 支付宝会赚钱吗 游戏主机硬件赚钱吗 捕鱼达人安卓版旧版本 坦克世界什么坦克最赚钱 华为彩票群 最终幻想15钱怎么赚钱 哪个充值软件赚钱 捕鱼大富翁官网 网上卖健身赚钱 有什么可以用步数赚钱的软件 银豹彩票安卓 开早餐店好赚钱吗