轉錄組作為基因組的功能元件，包括了多種不同類別的分子，如mRNA，miRNA，lncRNA，cirRNA，rRNA，tRNA，piRNA等。每一類分子在生理響應過程中都發揮了重要的作用。理解這些分子的調控對于更好理解功能基因組極為關鍵。通過轉錄組高通量測序技術，比較不同組織、細胞之間的轉錄組層面的表達量變化或結構變異（如cSNP、可變剪接、融合基因等），可以揭示生物學現象或疾病發生的分子機制。
技術參數
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樣本 |
總量&濃度 |
文庫類型 |
目標RNA富集方式 |
推薦數據量 |
測序策略 |
項目周期 |
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數字基因表達譜（DGE） |
Total |
基因組DNA |
普通轉錄組文庫 |
Olig dT磁珠調取mRNA |
≥3G clean data |
HiSeq PE150 |
35個工作日 |
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真核轉錄組 |
m≥30 μg，c≥100 ng/μL |
普通轉錄組文庫 |
Olig dT磁珠調取mRNA |
≥8G clean data |
HiSeq PE150 |
35個工作日 |
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原核轉錄組 |
PacBio為主，與HiSeq等其他平臺結合 |
普通轉錄組文庫/鏈特異性文庫 |
Ribozero試劑盒去除rRNA |
≥2G clean data (有參) ≥3G clean data（無參） |
HiSeq PE150 |
35個工作日 |
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miRNA |
m≥3 μg c≥200 ng/μL |
Small RNA文庫 |
≥10M reads |
HiSeq SE50 |
35個工作日 |
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lncRNA |
m≥4 μg c≥120 ng/μL |
鏈特異性文庫 |
Ribozero試劑盒去除rRNA |
≥12G clean data |
HiSeq PE150 |
45個工作日 |
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